袋式除尘器的运转可分为试运转与日常运转。首先，进行试运转时，对系统的单一部件进行检查，然后作适应性运转，并要作部分性能试验。在日常运转中，仍应进行必要的检查，特别是对袋式除尘器的性能的检查。要注意主机设备负荷的变化会对除尘器性能产生的影响。在机器开动之后，应密切注意袋式除尘器的工作状况，做好有关记录。
袋式除尘器要特别注意采取防止燃烧、爆炸和火灾事故的措施。在处理燃烧气体或高温气体时，常常有未完全燃烧的粉尘、火星、有燃烧和爆炸性气体等进入系统之中，有些粉尘具有自燃着火的性质或带电性，同时，大多数滤料的材质又都是易燃烧、磨擦易产生积聚静电的，在这样的运转条件下，存在着发生燃烧、爆炸事故的危害，这类事故的后果往往是很严重的。
布袋除尘器应很好地考虑采取防火、防爆措施，如：
在除尘器的前面设燃烧室或火星捕集器，以便使未完全燃烧的粉尘与气体完全燃烧或把火星捕集下来。
采取防止静电积聚的措施，各部分用导电材料接地，或在滤料制造时加入导电纤维。
防止粉尘的堆积或积聚，以免粉尘的自燃和爆炸。
人进入袋室或管道检查或检修前，务必通风换气，严防CO中毒。
