由于对自来水水源环境和下水道二次处理水再利用的关注，臭氧去除水体颜色的研究也越来越受到人们的重视。对于腐殖质引起的色味，水质色度平均为10度。多20度。这种色度靠一般的凝结沉淀和砂滤工序是无法完全去除的水质标准，甚至还有超过不良标准的可能性。用臭氧处理后，色度可降至l度以下，一般的自来水因铁、锰含量过高而着色，这些金属如为游离态，用常规方法可完全去除。如果原水中含有腐殖质，有时形成铬盐，按常规处理就很难了。脱色也是引入臭氧处理的一个重要因素。
臭氧脱色机理：随着分子生物学的蓬勃发展，微生态学将生态系统扩展到分子水平。实际上，不论蛋白质或核酸分子属于有机物质，它们都是由碳、氢、氧、氮、磷或硫(C、N、O、N、P或S)组成的，同时，病毒的外壳也是由许多蛋白质亚单位即壳颗粒组成的。每一个壳细胞都是由非共价键连接而成，并且对称地缠绕在一起，蛋白质是由多个链组成，核酸是由核苷酸链连接而成。就整体而言，OH是电中性的(R-OH)，但是如果从基团的内部来看，它的一部分有更多的负电荷(如氧原子)，而由于基团的另一部分(R-OH)有“额外”的成键电子，因此它有负电：另一部分则有更多的正电(如氢原子)，而这部分基团缺少成键电子，因此它有正电。如果存在另一个相似的基团，正电荷和负电荷之间相互吸引就会产生一个弱键，也就是所谓的氢键，例如多肽的基团之间，核苷酸的同基间，以及DNA或RNA分子中的同基对，都容易形成氢键。尽管单个氢键很弱，但许多氢键结合在一起，就形成了坚韧的植物细胞壁。现在再看臭氧，它是一种强氧化剂，具有较高的氧化电位(2.07ev)。所有具有高电负性的元素都能强烈地吸引电子，相互氧化，自我恢复。造成核酸分解，蛋白质解体，抗原变性，转阴，颜色褪尽等氧化结果。