甲鱼是变温动物，外界环境温度的变化直接影响它的摄食和活动。在水温低于20℃时，其摄食和活动逐渐减少，15℃时停食，12℃时便钻入泥中进行冬眠，以此来减少自身消耗，维系生命。按往年积累的经验，造成越冬期间甲鱼大量死亡的主要原因有:一、营养不良;二、冬眠前或是冬眠中甲鱼受伤或是被病菌感染;三、池塘的环境遭受污染。针对这些情况，采取相应的措施来加强越冬管理，能让甲鱼安全过冬。[4]
在甲鱼冬眠前，添加高脂肪的能量饲料，增强体质和抵抗力。一般来说，可在日常饲料中加入一些动物的肝脏，同时每天每百斤甲鱼的饲料中添加1.5-4.5克VE粉剂、0.5-1可VC粉剂、100-200毫克复合VB溶液、3-5克土霉素，连续喂养一周即可。
池塘的水温降到15℃-18℃时，要进行的换水，换水的水温差不高于2℃。养殖甲鱼的水池如果有水葫芦、浮萍等水生植物的种植，换水前需要打捞干净，防止后期腐烂，造成水质恶化，水中缺氧。换水时，先注入50厘米后，用3-5pm的漂白粉全池抛洒，用药第二天黎明之前爬台的甲鱼需要抓出来进行温室养殖或出售;用药48小时后，可加注水到1米;再隔24小时，可用50-70pm的生石灰水全池抛洒，第二天将爬台甲鱼抓出;此后便可让池内甲鱼准备越冬。
在整个越冬过程中，需让水位保持在0.8-1.2米之间，让甲鱼处在相对恒定的水温环境中，在添水时水流要缓慢，不能发出大的声响惊扰冬眠甲鱼;当气温降低，水面结冰时，需要打孔增氧，若被雪掩埋，需要及时清理积雪让光线透入池内。